O Spa, inaugurado em 2004, apresenta as mais recentes terapias de beleza e bem-estar, numa atmosfera tranquila e exclusiva.

O Spa apresenta uma piscina interior aquecida com jactos contra-corrente e jactos de massagem, banho turco e sauna (masculinos e femininos), além de 6 salas de massagens e ginásio.

Dispõe ainda de um jacuzzi exterior com uma fantástica vista para a Ria Formosa.
Dos diversos tratamentos do Spa, destacam-se as diferentes máscaras faciais, as massagens clássicas e orientais, massagem com pedras quentes vulcânicas, Shiatsu, hidromassagens, uma alargada gama de tratamentos à base de aromaterapia, bem como uma linha de tratamentos desenvolvidos exclusivamente para o Hotel Quinta do Lago.

No Verão 2008 foram introduzidas novidades como os tratamentos faciais e corporais à base de aloe vera e videira vermelha.

Ainda aparece como novidade o tratamento corporal à base de chá verde, ideal no combate de nódulos de gordura e celulite.